Das Rechnungsprüfungsamt ist eine unabhängige, an keine Weisungen gebundene Prüfungsinstanz und als Stabstelle dem Landrat unterstellt. Das Amt ist für die interne Finanzkontrolle innerhalb der Kreisverwaltung zuständig und kontrolliert die Haushalts- und Wirtschaftsführung des Landkreises Biberach. Die Einnahmen und Ausgaben des Landkreises werden im Hinblick auf ihre Ordnungs- und Rechtmäßigkeit, sowie auf Wirtschaftlichkeit und Sparsamkeit einer Kontrolle unterworfen.

Die vielfältigen Aufgaben der Prüfung, Kontrolle, Überwachung und Prävention werden insbesondere im Rahmen der folgenden Aufgabenfelder wahrgenommen: 

• Allgemeine Finanzprüfung
• Vergabekontrollstelle
• Bauprüfung
• Beratung.

Außerdem ist der behördliche Datenschutzbeauftragte beim Rechnungsprüfungsamt angebunden. Er unterstützt das Landratsamt bei der Ausführung des Landesdatenschutzgesetzes sowie anderen Vorschriften über den Datenschutz.